MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187122	CCT	2	6	59	64	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187122	A	6	6	77	82	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187122	A	6	6	88	93	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187122	T	7	7	103	109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187122	CTG	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187122	TTG	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187122	AAC	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187122	AAAT	2	8	2172	2179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187122	CCT	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NT_187122	CTGC	2	8	2467	2474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NT_187122	CAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187122	A	6	6	2554	2559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187122	TA	3	6	2660	2665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187122	TGT	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187122	A	6	6	5882	5887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187122	TTCAT	2	10	6499	6508	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NT_187122	AGCGC	2	10	8743	8752	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NT_187122	AAT	2	6	10331	10336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187122	ACG	2	6	12252	12257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187122	GTT	2	6	13428	13433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187122	TGA	2	6	13466	13471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187122	TGA	2	6	13499	13504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187122	A	7	7	13515	13521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187122	ACCAG	2	10	13538	13547	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NT_187122	TTTAA	2	10	14958	14967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187122	A	6	6	14980	14985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187122	ATC	2	6	15839	15844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187122	GCAG	2	8	17688	17695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NT_187122	CCA	2	6	17723	17728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NT_187122	AGAA	2	8	17732	17739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187122	CA	3	6	17755	17760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NT_187122	A	7	7	17760	17766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187122	TAC	2	6	17795	17800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187122	CGT	2	6	19693	19698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187122	AG	3	6	19720	19725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187122	GGA	2	6	19759	19764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187122	TAC	2	6	21249	21254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187122	T	7	7	21256	21262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187122	GAA	2	6	21275	21280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187122	T	7	7	21408	21414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187122	ATAA	2	8	21420	21427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187122	AGA	2	6	21428	21433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187122	T	6	6	21508	21513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187122	TAA	2	6	22217	22222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187122	TTCC	2	8	22254	22261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NT_187122	TTC	2	6	22262	22267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187122	AGAA	2	8	22292	22299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187122	A	9	9	22394	22402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187122	GCC	2	6	25196	25201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NT_187122	CTCC	2	8	27301	27308	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NT_187122	GTTT	2	8	28090	28097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187122	GTA	2	6	28108	28113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187122	CA	3	6	29585	29590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NT_187122	TAA	2	6	29726	29731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187122	TCGAT	2	10	29757	29766	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NT_187122	CT	3	6	29799	29804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NT_187122	AAG	2	6	29815	29820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187122	GAAAC	2	10	29836	29845	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NT_187122	AAC	2	6	29867	29872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187122	CGT	2	6	29913	29918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187122	T	8	8	29918	29925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187122	T	8	8	29929	29936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187122	TAA	2	6	30582	30587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187122	GGGC	2	8	30633	30640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NT_187122	AAGCG	2	10	30641	30650	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NT_187122	AGA	2	6	32667	32672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187122	TTTA	2	8	32677	32684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187122	TTA	2	6	32708	32713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187122	TAA	2	6	32748	32753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187122	AAC	2	6	32855	32860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187122	CCA	2	6	32899	32904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NT_187122	A	6	6	33461	33466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187122	ATT	2	6	33973	33978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187122	ATT	2	6	34018	34023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187122	TTG	2	6	34040	34045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187122	A	7	7	34075	34081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187122	CAC	2	6	38076	38081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NT_187122	T	6	6	38185	38190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187122	CA	3	6	38209	38214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NT_187122	TCAT	2	8	38231	38238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NT_187122	GGC	2	6	38253	38258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187122	AGG	2	6	38322	38327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187122	ATG	2	6	40362	40367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187122	TCC	2	6	44298	44303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NT_187122	A	7	7	44318	44324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187122	CTA	2	6	45320	45325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187122	TTC	2	6	48429	48434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187122	TTA	2	6	48452	48457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187122	TGA	2	6	48533	48538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187122	A	6	6	48538	48543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187122	ATT	2	6	48558	48563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187122	CCA	2	6	48607	48612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NT_187122	AAC	2	6	48622	48627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187122	CA	3	6	48630	48635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NT_187122	GCC	2	6	48637	48642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NT_187122	AAT	2	6	48686	48691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187122	C	6	6	48726	48731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NT_187122	AAGCG	2	10	48746	48755	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.